媽宮城亦稱澎湖城、也稱光緒城。也是清朝最後一座築建的防禦性城池。
光緒十一年（１８８５）二月十三日法軍攻佔媽宮，同年六月，中、法議和後法軍撤離澎湖。清廷為提高澎湖的防禦，特增派兵勇，並任命吳宏洛為澎湖鎮總兵駐守媽宮。
　光緒十二年（１８８６）十一月總兵吳宏洛奉命辦理澎湖防務，經閩浙總督楊昌濬和臺灣巡撫劉銘傳商談建城之議後，配合媽宮地區的紳民稟請建城。光緒十三年（１８８６）澎湖鎮總兵吳宏洛奉劉銘傳令，建媽宮城。
　依《澎湖廳志》卷二規制城池載：「周圍長七百八十九丈二尺五寸，牆垛五百七十個，牆身連垛計高一丈八尺，腳跟入地三尺五寸，厚二丈四尺，設東門（朝陽門）、大西門、南門（迎薰門）、北門（拱辰門）、小南門（即敘門）、小西門（順承門）共六門。東門臨海，西接金龜頭砲臺，北面護城河一道。其東、西、北、小西、小南五門，上蓋敵樓各一座；東西北三門內旁，蓋更樓各兩間，西間內南道更樓一門。又東城安設砲位一尊，城牆內蓋兵房四間。」（註：按《澎湖廳志》（１８９３）林豪所繪澎湖城圖和日治時期拍攝照片所示，六門中唯一未蓋敵樓者為大西門。《澎湖廳志》卷二城池　記錄文中「其東西北小西小南五門上蓋敵樓各一座」。其原著「西」字應是「南」字之筆誤。　另媽宮城中，即敘門與迎薰門二城門，何者為南門或小南門，在《澎湖廳志》澎湖城圖和城池文字記錄上並未有明確記載。近代澎湖縣志史，即有即敘門（小南門）、迎薰門（南門），和即敘門（南門）迎薰門（小南門）兩種不同名稱的記載。日治時期澎湖廳政府為了加強海港的功能性，和媽宮市街的擴充計劃，於明治四十年二月十五日開始執行拆除媽宮城築港工程。首先拆除即敘門到迎薰門及東角砲台東南臨海部份城牆，做為媽宮港第二棧橋至第三棧橋間的築港材料。第二階段於昭和十三年十月十日起拆除東門（朝陽門）至北門（拱辰門）段城牆，自此媽宮即不再區分城內、城外了。而媽宮城也維持了近五十年的歷史使命。
　今媽宮垣尚遺留部份，北起自北門西側（拱辰門）今公共汽車候車站西側路口，沿觀音亭東側城垣（介壽路旁）到大西門（今中興門），再南下至小西門（順承門）處。日治時期為澎湖要塞司令部，台灣光復後改為澎湖防衛司令部所在地的外圍城垣。
　媽宮城小南城門（即敘門）原址位於今中山路與民族交叉路口處。南門（迎薰門）原址位於今中山路與中正路交叉路口處。東城砲台又名東角砲台，原址位於今仁愛路二號現址。東城門（朝陽門）原址位於今民生路與民權路、重慶街、光復路、中華路交叉路口處。北城門（拱辰門）原址位於今民生路與民族路交叉路口處。西城門（大西門）原址位於介壽路澎湖防衛司令部中正堂對面，民國五十一年改稱為中興門（未拆除）。小西城門（順承門）位於中仙路盡西處，民國六十一年修護後，列為國家二級古蹟。民國七十五年重加整修，民國八十九年再予修復呈現今貌。