施公祠原為紀念清初施琅功勳，萬軍井則是相傳施琅駐兵澎湖時的汲水井，因施琅向神明祈求而井泉立刻湧出，且日夜不斷，因而得名，又名「師泉井」。澎湖施公祠原稱施將軍廟，原廟應該興建於康熙中葉時期，詳確時間，目前已經不可考。到了道光時期，改名為施公祠。施公祠原在澳東街，與海山館為鄰，中法戰爭中受損。日本治臺後，大正三年（1914年）因土地徵用，便與海壇館一同遷入原屬海壇標兵的伙房中一同祭祀，之後並由施琅部屬後代重建。
　施公祠除入口外，其餘四面皆由密實的墻體所圍繞，空間封閉為其特色，外埕不大。萬軍井外徑 107公分，內徑公分80，井深約三公尺。地面上井身為現代紅磚水泥砌成，地平面下井壁則以玄武岩疊砌而成。施公祠自從日據時期遷至海壇館後，是一座形式如同民宅的單進兩護龍三合院的建築，坐北朝南，主祀靖海侯－施琅。建築構造由承重牆與山牆式木屋構架所混合構築而成。 PS.施公祠是一般私人住家,要參觀前需先經過人家同意喔!!